Birçok hastalıkta akupunktur tekniklerinin faydaları gösterilmiştir. Dünya Sağlık Örgütü’ne (WHO) göre akupunktur, 70’den fazla sayıda rahatsızlığın tedavisinde endikedir. Bunların başlıcaları şunlardır:

• Akupunktur ile zayıflama
• Akupunktur ile Menopozal Şikayetlerin Tedavisi
• Baş ağrıları
• Sigara bırakma
• Enürezis – Çocuklarda idrar kaçırma
• Kas, eklem ve bel ağrıları
• Esansiyel hipertansiyon
• Renal kolik
• Facial paralizi (Yüz felci)
• Stres, panik atak ve depresyon gibi duygudurum bozuklukları
• Uykusuzluk
• Doğum ağrısının azaltılması
• Adet ağrıları (premenstrüel sendrom)
• Spastik kolon
• Sınav korkusu, uçak korkusu

Dünya Sağlık Örgütü’ne göre akupunkturun endike olduğu rahatsızlıkların tam listesi şöyledir: Sırt ve bel ağrıları; Boyun ağrıları; Eklem ağrıları; Frozen Sholder (donmuş omuz); Siyatik; Tenisçi dirseği; Gonartroz (Diz kireçlenmesi); Aşırı zayıflık; Omuzun periartriti; Trigeminal nevralji; Baş ağrıları; Boyun kireçlenmesine bağlı baş ağrıları; Migren; Sinüzit; Gerilim tipi baş ağrıları; Diş ağrıları; Temporo-mandibüler eklem (Çene eklemi) disfonksiyonu; Romatoidartritis; Operasyon sonrası ağrıları; Doğum indüksiyonu; Bebeğin anne karnındaki malpozisyonunun düzeltilmesi; Gebelik bulantı ve kusmaları; Felç (İlk 3–6 ay içinde); Esansiyel hipertansiyon; Renal kolik; Lökopeni; Radyasyon ve kemoterapi yan etkilerinin tedavisinde; Alerjik rinit; Akne vulgaris; Alkol bağımlılığı ve detoksifikasyonu; Facial paralizi (Yüz felci); Astım bronşiale; Kanser ağrılarında; Kolesistit (Safra kesesi iltihabı); Kolelitiasis (Safra kesesi taşı); Stres; Panik atak; Depresyon; Akut epigastralji; Peptik ülser; Abdominal ağrılar; Fibromiyalji ve tendinitis; Gut artriti; Uykusuzluk; Doğum ağrısının azaltılması; Süt eksikliği; Obezite; Morfin, kokain bağımlılığı; Osteoartritis; Burger (Trombo-anjitisobliterans) hastalığı; Polikistikover sendromu (PCOS); Premenstrüel sendrom; Kronik prostat iltihabı; Pruritus; Raynaud sendromu; Tekrarlayıcı üriner enfeksiyonlar; İdrar retansiyonu; Nikotin bağımlılığı – Sigara bırakma tedavileri; Ülseratif kolit; Spastik kolon; Ürolithiazis; Boğmaca; Erkek seksüel bozukluğu (İktidarsızlık – Organik olmayan); Meniere hastalığı; Post herpetik ağrılar; Tip 2 Diabetes mellitus (Şeker hastalığı); Kulak ağrıları; Epistaksis (Burun kanamaları); Kadın infertilitesi (Kısırlık – Organik bulgusu olmayan); Bilier kolik; Primer dismenore; Sınav korkusu; Uçak korkusu; Hıçkırık